Mac OS X Leopard war auf dem MacBook Air bereits vorinstalliert. Wie bei frisch erworbenen Mac OS X Systemen üblich, muss man sich zuerst registrieren und ein paar Angaben über sich selbst abgeben, diese werden dann auch direkt ins Adressbuch übertragen. In Mac OS X Leopard ist auch das iLife 08 Softwarepaket enthalten. iLife 08 liefert iPhoto, iMovie, .Mac Web Gallerie, Garage Band, iWeb und iDVD. Auch ein Mediacenter Programm wurde von Apple mitgeliefert, in Form von Front Row. Mac OS X lief sehr flüssig und lieferte im Vergleich zu anderen Mac Systemen keinen Grund zur Klage.

Windows Vista wurde unter zu Hilfenahme von Bootcamp installiert. Nachdem man unter Mac OS X die Größe der Partition eingestellt hat, legt man den Windows Vista Datenträger ein und startet das Notebook neu. Nun installiert man Windows Vista wie gewohnt. Als nächstes sollte man die Treiber von der Mac OS X DVD installieren. Windows Vista lief von Anfang an einwandfrei. Nur das Touchpad funktionierte nicht ganz so wie erhofft. Während einige Funktionen, wie das Scrollen mit zwei Fingern einwandfrei klappten, funktionierten andere Features gar nicht. Beispielsweise lässt sich durch das Antippen des Pads mit einem Finger kein Linksklick ausführen, und auch der Rechtsklick fehlt. Mit einer Maus funktionierte alles wie gewohnt. Leider wird die Stromspartechnologie Speedstep nicht aktiviert, wodurch sich die CPU Frequenz und Kernspannung im Leerlaufmodus nicht reduziert. Dies verursacht erhöhte Temperaturen, in Folge dessen einen öfters drehenden Lüfter und erhöhten Akkuverbrauch.