Das Betriebssystem Windows XP SP3 war bereits auf unserem Testexemplar vorinstalliert. Mit 33 Sekunden startet Windows auch ausreichend schnell, alle Komponenten liefen einwandfrei. Im Vergleich zu Windows Vista lässt es sich mit Windows XP viel schneller und ressourcensparender arbeiten. Vor allem lassen sich mehr Applikationen gleichzeitig betreiben, ohne dass das System besonders ausgelastet ist.

Für den Betrieb als reinen Office- und Büro-PC ist Vista Home Basic zu empfehlen, da hier die Aero-Oberfläche nicht aktiviert ist, die recht viel Performance schluckt. Windows Vista Home Premium sollte man auf jeden Fall nur auf dem neuen Wind PC D130 mit Intel Atom 330 Dual-Core Prozessor einsetzen, da dieser etwas mehr Spielraum für Multitasking bietet. Für Vista müssen eventuell die neuesten Treiber von der  MSI Homepage heruntergeladen werden, da diese auf den Treiber-CDs noch nicht ganz aktuell waren und dort LAN noch nicht funktionierte. Windows Vista läuft auch auf dem MSI Wind PC mit Intel Atom 230 Single-Core Prozessor ohne Probleme, im Vergleich zu Windows XP ist es jedoch deutlich langsamer.

Die Installation von Ubuntu Linux verlief problemlos. Nach dem ersten Start - die Startzeit beträgt über 1 Minute - funktionierten Grafik, Netzwerk und Audio problemlos. Es kam jedoch zu einer Fehlermeldung während des Aufwachens aus dem Standby Modus. Nach einer kurzen Ladezeit quittierte der MSI Wind Desktop Mini-PC den Betrieb und stürzte ab, erst nach einem Neustart konnte Ubuntu Linux wieder in Betrieb genommen werden. Ubuntu Linux hinterlässt in Kombination mit dem MSI Wind Desktop einen guten Eindruck, abgesehen von der langen Startzeit und dem Fehler beim StandBy, lässt es sich ähnlich wie mit Windows XP sehr angenehm und flott arbeiten.